{"id":2874,"date":"2024-10-15T13:00:39","date_gmt":"2024-10-15T13:00:39","guid":{"rendered":"https:\/\/neurobiodiversidade.org\/?p=2874"},"modified":"2024-10-15T14:25:09","modified_gmt":"2024-10-15T14:25:09","slug":"como-surgiu-o-stitcher-nossa-ferramenta-de-modelagem-3d-de-cerebros","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/neurobiodiversidade.org\/en\/como-surgiu-o-stitcher-nossa-ferramenta-de-modelagem-3d-de-cerebros\/","title":{"rendered":"Como surgiu o Stitcher, nossa ferramenta de modelagem 3D de c\u00e9rebros?"},"content":{"rendered":"<p>Antes mesmo de iniciar o meu mestrado, ainda em 2019, eu, Kamilla (na \u00e9poca aluna de doutorado) e o prof. Bruno Mota, nosso orientador em comum, nos deparamos com o desafio de estudar c\u00e9rebros de cet\u00e1ceos. Apesar das motiva\u00e7\u00f5es serem diversas, era certa a necessidade de se criar um modelo fidedigno da anatomia do c\u00f3rtex desses animais na forma de um objeto tridimensional computadorizado. Assim, logo antes de ingressar na p\u00f3s-gradua\u00e7\u00e3o em f\u00edsica, havia definido que meu tema de pesquisa seria desenvolver uma t\u00e9cnica para estudos de neuroanatomia, especialmente dedicada a golfinhos.<\/p>\n\n\n\n<p>Logo de cara, a op\u00e7\u00e3o mais imediata seria utilizar algum <em>software<\/em> dispon\u00edvel e adapt\u00e1-lo para cada uma das esp\u00e9cies que ir\u00edamos analisar. Infelizmente, o que havia dispon\u00edvel \u00e0 \u00e9poca era incompat\u00edvel com esp\u00e9cies n\u00e3o-primatas e\/ou n\u00e3o gerava uma representa\u00e7\u00e3o realista. Dessa forma, teria que come\u00e7ar do zero, e assim foi feito.<\/p>\n\n\n\n<p>Durante os meus anos de mestrado, adaptei um algoritmo de processamento gr\u00e1fico para gerar superf\u00edcies tridimensionais trianguladas, chamadas reconstru\u00e7\u00f5es, de tal forma que obedecesse \u00e0s leis f\u00edsicas e biol\u00f3gicas dos c\u00e9rebros. Surgia, assim, o Stitcher, que viria a ser nossa principal ferramenta de an\u00e1lise num futuro pr\u00f3ximo.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>O desenvolvimento do Stitcher foi muito similar ao trabalho de cientista da computa\u00e7\u00e3o, com centenas de horas acumuladas em frente ao computador escrevendo minuciosamente cada linha de c\u00f3digo. Por\u00e9m, diferente do processo habitual, o Stitcher requer uma rigorosidade cient\u00edfica para gerar resultados, al\u00e9m de parecidos visualmente, acurados em termos matem\u00e1ticos.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image aligncenter size-large is-resized\"><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" width=\"1024\" height=\"550\" src=\"https:\/\/neurobiodiversidade.org\/wp-content\/uploads\/2024\/10\/WhatsApp-Image-2024-10-15-at-09.57.45-1-1024x550.jpeg\" alt=\"\" class=\"wp-image-2880\" style=\"width:777px;height:auto\" srcset=\"https:\/\/neurobiodiversidade.org\/wp-content\/uploads\/2024\/10\/WhatsApp-Image-2024-10-15-at-09.57.45-1-1024x550.jpeg 1024w, https:\/\/neurobiodiversidade.org\/wp-content\/uploads\/2024\/10\/WhatsApp-Image-2024-10-15-at-09.57.45-1-300x161.jpeg 300w, https:\/\/neurobiodiversidade.org\/wp-content\/uploads\/2024\/10\/WhatsApp-Image-2024-10-15-at-09.57.45-1-768x413.jpeg 768w, https:\/\/neurobiodiversidade.org\/wp-content\/uploads\/2024\/10\/WhatsApp-Image-2024-10-15-at-09.57.45-1-18x10.jpeg 18w, https:\/\/neurobiodiversidade.org\/wp-content\/uploads\/2024\/10\/WhatsApp-Image-2024-10-15-at-09.57.45-1.jpeg 1280w\" sizes=\"(max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p><\/p>\n\n\n\n<p>Hoje j\u00e1 temos a primeiro <a href=\"https:\/\/link.springer.com\/article\/10.1007\/s12021-024-09678-2\">artigo do Stitcher<\/a>, que descreve o funcionamento da ferramenta, assim como uma <a href=\"https:\/\/doi.org\/10.57736\/da99-94c5\">apresenta\u00e7\u00e3o no congresso de neuroci\u00eancia FENS<\/a>, ocorrido em Viena deste ano. Em breve, um segundo artigo trar\u00e1 uma valida\u00e7\u00e3o da nossa ferramenta, mostrando justamente a precis\u00e3o dos modelos corticais reconstru\u00eddos tridimensionalmente.<\/p>\n\n\n\n<p><\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Antes mesmo de iniciar o meu mestrado, ainda em 2019, eu, Kamilla (na \u00e9poca aluna de doutorado) e o prof. Bruno Mota, nosso orientador em comum, nos deparamos com o desafio de estudar c\u00e9rebros de cet\u00e1ceos. 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